martes, 18 de septiembre de 2012

dbSNP


La base de datos de polimorfismo de nucleótido único (dbSNP)

[Base de datos de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y múltiples variaciones de pequeña escala que incluyen inserciones / deleciones, microsatélites, y variantes no polimórficos.]


Es un archivo público y gratuito para la variación genética dentro y entre las diferentes especies desarrollados y acogido por el Centro Nacional de Información sobre Biotecnología (NCBI) en colaboración con el National Human Genome Research Institute(NHGRI). Aunque el nombre de la base de datos implica una colección de una clase de polimorfismos solamente (es decir, polimorfismos de nucleótido único (SNP)), que, de hecho, contiene un rango de variación molecular: SNPs , y corta deleción polimorfismos de inserción ( indeles / DIP),  de microsatélites marcadores orepeticiones cortas en tándem (STRs), polimorfismos multinucleotide (MNPs), las secuencias de heterocigotos y variantes  con nombre. El dbSNP acepta polimorfismos aparentemente neutrales, polimorfismos correspondientes a fenotipos conocidos, y las regiones de ninguna variación. Fue creado en septiembre de 1998 como complemento a GenBank , NCBI colección de ácido nucleico a disposición del público y secuencias de proteínas. 











A partir del construido 131 (disponible febrero de 2010), dbSNP había acumulado más de 184 millones presentaciones que representan a más de 64 millones de variantes distintas para 55 organismos, incluyendo el Homo sapiens ,Mus musculus , Oryza sativa , y muchas otras especies. Una lista completa de los organismos y el número de presentaciones para cada uno se puede encontrar en: 


http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_summary.cgi


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